Uganda leidet seit seiner Unabhängigkeit im Jahr 1962 immer wieder unter Konflikten. Im Jahr 1967 stürzte der erste Premierminister, Dr. Milton Obote, den ersten Präsidenten des Landes, Sir Edward Mutesa II, und rief Uganda zur Republik aus. Es folgten mehrere Militärputsche und gewaltsame Regime – einschließlich desjenigen von Idi Amin (1971-1979) -, die seither Hunderttausende von Toten und anhaltendes Leid für die Menschen in Uganda zur Folge hatten. 55 Jahre nach der Unabhängigkeit hat das Land noch keine demokratische Machtübergabe erlebt.
Der letzte Staatsstreich im Jahr 1986 brachte den derzeitigen Präsidenten Yoweri Museveni an die Macht. Seine Regierung sieht sich einer bewaffneten Opposition aus verschiedenen Gruppen im ganzen Land gegenüber. Durch eine Mischung aus Diktatur und Manipulation hat Museveni die Macht im Land seit 31 Jahren fest im Griff.
Seit den 1990er Jahren war Uganda in eine Reihe von Bürgerkriegen verwickelt, von denen der langwierigste ein 20-jähriger Krieg gegen Joseph Konys Lord’s Resistance Army (LRA) war, deren Ziel es war, einen Staat auf der Grundlage der Zehn Gebote zu errichten. Berühmt-berüchtigt wurde die LRA durch die Entführung von 60.000 Kindern, die als Kindersoldaten und Sexsklaven dienen sollten.
Auf die Friedensgespräche in Juba von 2006 bis 2008 folgte eine Phase der Stabilität, doch nach einer fehlgeschlagenen Militäroffensive, mit der die LRA in ihren Verstecken in Garamba ausgelöscht werden sollte, kam es bald wieder zu Gewalttaten, die zu den aktuellen Übergriffen in der Zentralafrikanischen Republik und in Teilen der Demokratischen Republik Kongo führten.
Im Jahr 2005 wurden die fünf führenden LRA-Anführer wegen Kriegsverbrechen und Verbrechen gegen die Menschlichkeit angeklagt. Seit 2017 muss sich nur noch ein jüngerer Befehlshaber, Dominic Ongwen, vor dem Internationalen Strafgerichtshof verantworten. Kony ist jedoch weiterhin auf freiem Fuß. Die von den USA unterstützte Regionale Task Force der Afrikanischen Union hat die Gruppe zurückgedrängt und im Mai 2017 den Abschluss ihrer Mission bekannt gegeben. Einige Analysten behaupten jedoch, dass aktive Splittergruppen in der Zentralafrikanischen Republik auf ein mögliches Wiederaufleben hinweisen.
Trotz früherer Bekenntnisse zu Demokratie und Menschenrechten hat Museveni auch seine Amtszeitbeschränkung aufgehoben. Seine mehrfachen Wiederwahlen wurden von Vorwürfen des Wahlbetrugs und der Gewalt überschattet. Im Jahr 2016 wurden sein Gegner, Dr. Kizza Besigye, und seine Anhänger von den Sicherheitskräften gewaltsam und scheinbar ungestraft verfolgt. Im September 2017 unternahm Museveni im Parlament einen energischen Vorstoß zur Änderung von Artikel 102 (b) der Verfassung, um die Amtszeitbeschränkung für das ugandische Präsidentenamt aufzuheben und den Weg für eine lebenslange Amtszeit zu ebnen.
Eine Million sudanesische Flüchtlinge sind vor dem Bürgerkrieg nach Uganda geflohen und setzen den ugandischen Staat und die Gesellschaft weiter unter Druck.