Die erste große millenaristische Bewegung nach den frühchristlichen Gemeinden war der Montanismus. Montanus, sein Begründer, wollte die Begeisterung der Frühzeit der Kirche wiederherstellen. Die Bewegung des Montanus begann etwa 172 n. Chr. Er erwartete die Rückkehr des Herrn in Pepuza und Tymion, zwei kleinen Städten in Kleinasien. Das neue Jerusalem würde bald auf die Erde herabkommen und die tausendjährige Herrschaft Christi würde beginnen. Montanus ermutigte seine Anhänger, in strenger Askese zu leben, um sich auf diese Wiederkunft vorzubereiten. Die Kirche wandte sich gegen Montanus, weil der Millenarismus in der christlichen Lehre keine zentrale Rolle spielte und weil ekstatische Prophezeiungen und private Interpretationen die Kirchenzucht untergruben.

St. Augustinus von Hippo (354-430) schloss jahrhundertelang die Tür für millenarische Spekulationen, indem er gegen die Art von wörtlicher Auslegung der Heiligen Schrift schrieb, die ein physisches Paradies auf Erden versprach. Doch im frühen Mittelalter öffnete Joachim von Fiore (1130 oder 1135-1201 oder 1202) vielen apokalyptischen und Erneuerungsbewegungen wie den geistlichen Franziskanern und den Fraticelli wieder die Tür. Joachim glaubte, dass sich sein eigenes Zeitalter in einer Krise befand, und predigte, dass menschliches Handeln dazu beitragen würde, die Kirche in das letzte Stadium der Geschichte, das Zeitalter des Heiligen Geistes, zu führen.

In vielen Fällen verquickten sich millenarische Hoffnungen und Erwartungen mit politischen und sozialen Bestrebungen und führten zu einer gewaltsamen Vermischung – vor allem dann, wenn die Reformbemühungen, die durch starre kirchliche und weltliche Autoritäten blockiert wurden, radikal und extrem wurden. Jahrhundert in Böhmen und Mähren, als die hussitische Reformbewegung, vermischt mit unausgegorenen nationalistischen Gefühlen und sozialen Spannungen, zur hussitischen Revolution führte, die wiederum die radikale tausendjährige Bewegung der Taboriten hervorbrachte. Unter Verwendung religiöser Bilder und millenarischer Überzeugungen schufen die Taboriten eine kurzlebige millenarische Gesellschaft, die gewaltsam gegen die Kräfte kämpfte, die geschickt wurden, um sie zu zerschlagen.

Im Deutschland des 16. Jahrhunderts lösten die lutherischen Reformen ein Gefühl der Befreiung, aber auch der Orientierungslosigkeit inmitten der sozialen und religiösen Veränderungen aus. So wie Martin Luther apokalyptische Bilder benutzte, um den Papst als den Antichristen darzustellen, so stellte Thomas Müntzer Luther als die Bestie der Apokalypse dar, weil Luther Müntzers Reformbestrebungen entgegenwirkte. Müntzer setzte sich für eine soziale und religiöse Revolution ein und glaubte, dass alle, die sich diesem endzeitlichen Prozess widersetzten, gewaltsam vernichtet werden müssten. Die Täufergruppen kanalisierten die Reformhoffnungen in Bemühungen, ein neues goldenes Zeitalter zu errichten. Einige Gruppen predigten eine gewaltlose Erwartung der Endzeit, während andere Teile einen fanatischen Millenarismus entwickelten, als die Obrigkeit sich ihnen entgegenstellte. In Münster errichteten die Täufer das neue Königreich Zion, das 1535 ein gewaltsames und blutiges Ende fand.

Am Ende des sechzehnten und zu Beginn des siebzehnten Jahrhunderts lösten die politischen und religiösen Verhältnisse in England eine Welle von millenarischem Interesse und Begeisterung aus. Die englischen Puritaner interpretierten die biblischen Prophezeiungen über Unheil und die Wiederkunft zunehmend als auf die heutige Situation bezogen. Gelehrte Männer versuchten, aus der Heiligen Schrift das Datum zu entziffern, an dem das Ende der Welt eintreten könnte. Die radikalsten englischen Millenarier waren als die „Fifth Monarchy Men“ bekannt (in Anlehnung an die Vision, die im Buch Daniel, Kapitel 7, beschrieben wird). Im frühen achtzehnten Jahrhundert forderten die Camisards oder „französischen Propheten“ in Frankreich vom katholischen König eine gewisse Toleranz für ihre protestantische Kultur und Praxis. Die Kamisarden glaubten, dass ihre Leiden Teil von Gottes Plan für das kommende Jahrtausend waren. Laienpropheten, darunter viele Kinder, verkündeten inmitten körperlicher Manifestationen von Erschütterungen und Zuckungen, dass der Tag des Jüngsten Gerichts bald bevorstehe, dass die Herrschaft des Tieres der Apokalypse bald enden werde.