Im Jahr 2001 wurde Stoner Co-Moderatorin der Disney Channel Mike’s Super Short Show an der Seite von Michael Alan Johnson, einem Infomercial-Segment über bevorstehende Disney-Veröffentlichungen. In den Jahren 2003 und 2005 trat sie als Sarah, eines der zwölf Baker-Kinder, in den erfolgreichen Komödien Cheaper by the Dozen und Cheaper by the Dozen 2 auf. Sie hat auch in mehreren Fernsehserien mitgewirkt, die sich an ein jugendliches Publikum richten, darunter The Suite Life of Zack & Cody, That’s So Raven und Drake & Josh.
Im Jahr 2006 hatte sie eine kleine Filmrolle in Step Up als Camille, die jüngere Pflegeschwester von Channing Tatums Charakter. Von 2007 bis 2015 war sie die Stimme von Isabella Garcia-Shapiro und Jenny (bis zur 4. Staffel) in der Disney Channel-Zeichentrickserie Phineas und Ferb und erfand persönlich Isabellas Spruch „Whatcha doin‘?“. 2008 spielte sie die Hauptrolle in dem Disney Channel Originalfilm Camp Rock als Caitlyn Gellar, eine aufstrebende Musikproduzentin. Ihre Rolle in Camp Rock kam besonders gut an, da verschiedene Medien anmerkten, es sei an der Zeit, dass sie eine Hauptrolle spiele, nachdem sie bereits für andere große Namen wie Will Smith und Eminem eingesprungen war. Stoner spielte die Rolle der Alice McKinley in dem Film Alice Upside Down, der lose auf der Alice-Serie basiert, insbesondere auf The Agony of Alice von Phyllis Reynolds Naylor. Dies war ihre zweite Hauptrolle und laut einem Interview, das auf der Direct-to-DVD-Veröffentlichung erscheint, sagt sie, dass dies das erste Mal war, dass sie in jeder Szene eines Films auftreten musste.
Im Jahr 2008 sang sie zwei Songs, „Lost and Found“ und „Free Spirit“, aus dem Soundtrack des Films Alice Upside Down, in dem sie die Hauptrolle spielt. Außerdem hat sie eine Coverversion des Songs Dancing in the Moonlight für den Disney DVD/Blu-ray-Film Space Buddies (2009) aufgenommen. 2010 trat Stoner im dritten Step Up-Film Step Up 3D an der Seite von Adam Sevani auf, wo sie die Rolle erneut übernahm. Stoner lud auf ihrer offiziellen YouTube-Seite ein Video von ihrer letzten Tanzprobe hoch, in dem sie andere Darsteller vorstellte. Im selben Jahr kehrte Stoner zurück, um ihre Rolle als Caitlyn Gellar in Camp Rock 2: The Final Jam, einer Fortsetzung von Camp Rock, erneut zu spielen. Stoner hatte auch einen Gastauftritt in der Fernsehserie House als Skaterin.
Im Jahr 2011 begann Stoner mit Plattenproduzenten, Songwritern und einem Gesangscoach zusammenzuarbeiten, um ihren Gesangsstil für ihr erstes Studioalbum von „Kiddie-Pop“ zu einem gefühlvolleren Pop-Stil mit einem kleinen alternativen Einschlag zu verändern. Am 4. April 2010 veröffentlichte Stoner ein Video auf ihrem YouTube-Kanal, in dem sie die Veröffentlichung ihrer Debütsingle „Flying Forward“ am 20. April 2010 ankündigte. Stoner veröffentlichte 2011 ihre Debüt-EP mit dem Titel Beat the System. Sie trat auch in Wii Fit-Videos auf dem Nintendo-Kanal für die Wii-Videospielkonsole auf, in denen sie Gleichgewichtsübungen demonstrierte. Stoner ersetzte Hayden Panettiere als Stimme von Kairi in Kingdom Hearts Re:Chain of Memories, Xion in Kingdom Hearts 358/2 Days und beide Charaktere in Kingdom Hearts III. Sie sprach die Figur Opal in den Staffeln drei und vier von The Legend of Korra.
DancingEdit
Nach einer Choreografie-Ausbildung in Los Angeles trat Stoner als Background-Tänzerin in mehreren Musikvideos auf, insbesondere in Missy Elliotts „Work It“, „Gossip Folks“, „I’m Really Hot“, Eminems „Just Lose It“ und „No Tengo Dinero“ von den Kumbia Kings. Sie war auch Backgroundtänzerin für OutKast bei den Kids‘ Choice Awards 2004 und für Will Smith bei der Show 2005. Stoner tanzte zwischen 2003 und 2006 in einer Tanzgruppe namens The JammX Kids. Anfang 2006 verließ sie die Gruppe aufgrund von Terminkonflikten, arbeitet aber weiterhin mit den einzelnen Kids an verschiedenen Jobs. Sie war auch eine der Tänzerinnen in den Special Features der Shark Tale DVD.
Stoner unterrichtet Hip-Hop-Kurse im Millennium Dance Complex und gilt als die jüngste Person, die dort einen Meisterkurs unterrichtet hat. Sie trat auch in Debby Ryans „We Got the Beat“ für den Disney Channel’s Radio Rebel auf. Im Februar 2015 veröffentlichte sie ein Tanz-Tribut-Video zu Missy Elliot mit einem Mash-up-Medley aus Missy-Elliott-Videos, in denen sie als Jugendliche getanzt hatte. Innerhalb der ersten Woche wurde es mehr als 12 Millionen Mal aufgerufen. Missy Elliott lud Alyson ein, „Work It“ mit ihr bei den MTV Video Music Awards 2019 zu performen.
PublishingEdit
Stoner war die „Tanzredakteurin“ für das KEWL Magazine. Im Februar 2009 veröffentlichte Stoner das Alyson Stoner Project, das als „ein Tanzvideo-Hybrid, der viele Unterhaltungsstile in einem Paket vereint“ beschrieben wird. Regie führte Kevin Schmidt, ihr Co-Star aus Cheaper by the Dozen.