Selv om gnavere ofte er værter for ektoparasitter, der kan overføre zoonotiske sygdomme, er der ofte kun lidt viden om deres ektoparasitsamfund, selv på steder, hvor værterne ofte interagerer med mennesker. Yosemite National Park er et område med stor interaktion mellem mennesker og vilde dyr og et stort potentiale for overførsel af zoonotiske sygdomme. Ikke desto mindre er der relativt få undersøgelser, der har undersøgt loppesamfundene på pattedyrværter i dette område, og endnu færre har karakteriseret de miljø- og værtsfaktorer, der forudsiger angrebet. Vi fokuserede på to arter, alpine chipmunk (Tamias alpinus) og lodgepole chipmunk (T. speciosus), som lever i Yosemite og de omkringliggende områder, og som kan være værter for lopper, der er smittebærere af pest. Da disse værter reagerer forskelligt på miljøforandringer, er det værdifuldt at fastlægge basislinjer for deres loppesamfund, før der sker yderligere ændringer. Vi undersøgte lopper på disse chipmunk-værter i tre år (2013-2015), herunder i året med en pestepizooti (2015), og dokumenterede betydelige forskelle mellem værterne i loppesamfund og ændringer på tværs af årene. Loppehyppigheden var forbundet med værtsegenskaber, herunder køn og glukokortikoidmetabolitniveauer i fæces. Det gennemsnitlige antal lopper pr. individ og andelen af individer, der bærer lopper, steg på tværs af årene for T. speciosus, men ikke for T. alpinus. For bedre at forstå disse mønstre konstruerede vi modeller for at identificere miljømæssige forudsigere af loppehyppigheden for de to mest almindelige loppearter, Ceratophyllus ciliatus mononis og Eumolpianus eumolpi. Resultaterne viste værtsafhængige forskelle i de miljømæssige forudsigere af loppeforekomst for E. eumolpi og C. ciliatus mononis, med bemærkelsesværdige forbindelser til variation i omgivelsestemperatur og højde. Disse resultater giver indsigt i faktorer, der påvirker loppeforekomsten hos to jordegernarter, som kan være forbundet med klimaændringer og mulige fremtidige pestepizootier.