Saccharomyces genome database

Målet med Saccharomyces Genome Database (SGD) er at give oplysninger om denne gærs genom, de gener, den koder for, og deres biologiske funktioner. Genomsekvensen af S. cerevisiae giver den struktur, som oplysningerne i SGD er organiseret omkring; værdi tilføjes til sekvensen ved omhyggelig biologisk annotation hentet fra en række kilder. SGD kuraterer og lagrer oplysninger om DNA- og proteinsekvenser fra gær, genetik, cellebiologi og det tilhørende forskersamfund. SGD tilbyder også søge- og analyseværktøjer, der er udformet til at hjælpe forskere med at udforske dataene for at finde dele eller mønstre af biologiske oplysninger, der er relevante for deres interesser. En vedvarende udfordring for SGD’s personale er at præsentere ajourførte oplysninger om gærgener i et format, der er intuitivt og nyttigt for biomedicinske forskere, samtidig med at der tages hensyn til dette samfunds behov ved at stille ressourcer og værktøjer til rådighed til at udforske dataene på nye måder. I dette kapitel beskrives SGD’s organisation, kilderne til de data, der er lagret i SGD, nogle metoder til at hente oplysninger fra databasen, de forbindelser SGD har med eksterne databaser og forskningsmiljøer, der ikke er gærforskningsmiljøer, og SGD’s arkiv med oplysninger fra gærmiljøet.