Patogenese: De fleste arter er ikke væsentlige patogener og forårsager kun lidt eller ingen sygdom. Visse arter er imidlertid stærkt patogene og forårsager katarrhalisk eller hæmoragisk enteritis ved alvorlig erosion af slimhinderne gennem cellelysis, hvilket resulterer i kraftig vandig til blodig diarré. Den kliniske sygdom viser sig normalt ikke før kumulativ vævsskade i forbindelse med anden eller tredje generations skizogoni. Moderat angrebne dyr kan vise progressive tegn som dårlig vægtøgning eller vægttab, svaghed og afmagring, mens svært angrebne individer kan dø kort efter sygdomsudbruddet. Patogeniciteten afhænger af mange faktorer, f.eks. parasitart, levedygtighed, infektivitet, virulens, tropisme, værtens alder, ernæringsstatus, immunologisk kompetence samt de fremherskende miljøforhold (temperatur, fugtighed) og forvaltningspraksis. Unge dyr er mest modtagelige for klinisk sygdom, selv om de overlevende dyr udvikler en stærk specifik beskyttende immunitet mod efterfølgende infektion og sygdom.

Smitteform: Oocyster, der udskilles med værtens afføring, forurener det ydre miljø, men de skal gennemgå intern sporulation (sporozoitdannelse), før de bliver infektiøse. Nye værter smittes, når de indtager sporulerede oocyster, der er forurenet med fødevarer eller vand (fækal-oral overførsel). Efter indtagelse af oocyster og sporocyster udgydes i tarmene og frigiver deres sporozoitter, som invaderer værtscellerne og påbegynder merogoni. Stimuli til excystation omfatter passende fysisk-kemiske forhold efter maven, såsom iltniveau, pH, galdesalte, pancreatiske enzymer osv.

Differentialdiagnose: : Specifikke diagnoser: : Kliniske tegn er normalt sammenfaldende med parasittens patenteringstid (patenteret periode = periode, hvor der produceres oocyster). Infektioner diagnosticeres sædvanligvis ved koprologisk undersøgelse af værtsfæces for kokcidie-okyster (koncentreret ved hjælp af forskellige sedimentations-flotationsteknikker). Ufarvede oocyster observeres bedst ved lysmikroskopi med suboptimal gennemlysningsbelysning (kondensator nedadbøjet for at indføre diffraktion), fase-kontrast- eller interferenskontrastoptik. Friske fækale prøver kan kun indeholde usporulerede oocyster, så differentiel specifik diagnose kan undertiden kræve kortvarig opbevaring for at lette sporulationen (2 % kaliumdichromat anvendes ofte til at undertrykke mikrofloraen under opbevaring, men ikke for piscinearter, og køling kan forsinke processen, hvis det er nødvendigt for prøver i marken). Forskere har for nylig anvendt en række molekylære teknikker til at karakterisere den genetiske variation mellem og inden for parasitarter, men kun få teknikker er egnede til rutinemæssig diagnostisk brug.

Behandling og kontrol: Sygdomsprogressionen er normalt så hurtig, at enhver terapeutisk (helbredende) behandling simpelthen kan være for sent på den. Derfor anvendes kontinuerlig medicinering i foderet eller i vandet ofte til profylaktisk (forebyggende) behandling i mange intensive dyreindustrier. Der findes et bredt udvalg af lægemidler, herunder lægemidler med coccidio-statisk (reversibel undertrykkende) eller coccidio-cidal (irreversibel dødelig) virkning. De vigtigste lægemiddelgrupper omfatter sulfonamider (sulfanilamid, trimethoprim, ethopabat), pyridinoler (clopidol, decoquinat), nitrobenzamider (zoalene), organiske arsenikaler (roxarson), nitrofuraner (furazolidon, amprolium), quinazolinoner (halofuginon), polyether-ionofore antibiotika (monensin, laslocid, salinomycin, narasin), asymmetriske (diclazuril) og symmetriske (toltrazuril) triaziner. Desværre er der stigende problemer med lægemiddelresistens blandt mange kokkediearter, især mod syntetiske lægemidler, som har tendens til at persistere i parasitpopulationer. Mange industrier anbefaler periodisk rotation mellem forskellige lægemiddelgrupper og brug af kombinationslægemidler (cocktails) for at minimere forekomsten af resistens. De fleste infektioner med coccidier stimulerer udviklingen af stærke beskyttende immunresponser, om end de er forbigående, medmindre de er præmunitive (kortvarige, medmindre parasitterne er vedvarende). Der har været betydelig succes med bekæmpelse gennem immunprofylakse ved hjælp af svækkede eller tidligt udviklede stammer af parasitter, især i fjerkræindustrien. Forskere forsøger nu at udvikle rekombinante subcellulære vacciner. Udbrud kan generelt kontrolleres ved hjælp af forvaltningsmetoder, der er baseret på forbedring af hygiejnen, mindskelse af trængslen, fjernelse af kontamineret strøelse og isolering af smittede individer. Kemisk desinfektion er normalt upraktisk, da oocysterne er resistente over for mange konventionelle desinfektionsmidler.