Loggains fungerede som offensiv koordinator for Tennessee Titans fra 2012-2013 som en del af Mike Munchaks trænerstab. Få dage efter Ken Whisenhunt tog over som Titans-cheftræner i 2014 blev Loggains informeret om, at han ikke ville blive i organisationen. Han havde tidligere været holdets quarterbacks coach.
Loggains tilbragte 2014 som quarterbacks coach for Cleveland Browns. Han var en fortaler for at drafte Texas A&M quarterback Johnny Manziel.
Det følgende år søgte Loggains efter et job. Han blev interviewet til et job som offensiv koordinator af New York Giants, men blev i stedet ansat af Bears den 23. januar 2015 som quarterbacks coach. Under Loggains’ ledelse havde quarterback Jay Cutler en af sine bedste sæsoner, da han sluttede 2015 med 3.629 passing yards, 21 touchdowns, 11 interceptions og karrierens højeste værdier i passer rating (92,3) og completion percentage (64,4). De 11 interceptions var de laveste i hans karriere og resulterede i en interceptionsprocent på 2,3, hvilket er den laveste i en sæson, hvor han har startet mindst 12 kampe, mens 21 touchdowns var hans næstmest siden 2011 og de 3.629 yards var de tredjemest i hans karriere. På tredje down havde Cutler en passer rating på 103,2 (fjerde i NFL) efter at have gennemført 91 ud af 141 afleveringer for 1.242 yards, syv touchdowns og to interceptions. Mod Seattle Seahawks gennemførte backup-quarterback Jimmy Clausen mod Seattle Seahawks 9 ud af 17 afleveringer for 63 yards, og inklusive sacks noterede han 48 netto passing yards, hvilket er anden gang siden 1990-sæsonen, at Bears havde mindre end 50 netto passing yards. Bears sluttede året med 228,9 passing yards pr. kamp, hvilket var nummer 23 i ligaen, og quarterbackgruppen havde en samlet fuldførelsesprocent på 63,9 og en interceptionsprocent på 2,3, hvilket begge lå på tredjepladsen i holdets historie, sammen med 3.843 brutto passing yards og en 42.5 tredje down-procent (fjerde), 3.660 netto passing yards (femte), sammen med 5.514 samlede netto yards og en passer rating på 89,7 (sjette).
Loggains blev forfremmet til offensiv koordinator den 11. januar 2016, da Adam Gase forlod stillingen for at blive cheftræner for Miami Dolphins. Bears kæmpede i løbet af Loggains’ tid som OC, og i november 2017 placerede ESPN ham i en rangliste fra november 2017 på sidstepladsen blandt 32 playcallere, mens offensiven sluttede 2017-sæsonen med et gennemsnit på blot 16,5 point pr. kamp (29. i ligaen). Efter at cheftræner John Fox blev fyret, genforenedes Loggains med Gase i Miami, hvor han fik endnu en stilling som offensiv koordinator.
Den 23. januar 2019 genforenedes Loggains med Adam Gase igen, efter at han blev ansat som offensiv koordinator/quarterbacks coach for New York Jets. 25. oktober 2020, forud for kampen mod Buffalo Bills i uge 7, opgav cheftræner Adam Gase sine opgaver som offensiv play calling og overdrog dem til Loggains. Trods en stærk præstation i første halvleg med en 10-6 føring lykkedes det ikke Loggains at få momentum i anden halvleg, hvilket kulminerede med et 18-10 nederlag til Buffalo. Den 28. oktober 2020, forud for kampen mod Kansas City Chiefs, blev det rapporteret, at Loggains igen ville få offensive play calling opgaver.