Den Europæiske Union (EU) er en vigtig aktør inden for global sundhed og internationale anliggender og en stærk tilhænger af WHO’s rolle som det ledende organ for sundhed, både globalt og i regionen.

EU er en naturlig partner for WHO/Europa. Geografisk set er mere end halvdelen af WHO’s medlemsstater i den europæiske region medlem af EU eller søger at blive medlem.

WHO/Europas vigtigste partner i EU er Europa-Kommissionen på grund af dens administrative, udøvende, lovgivende og retlige ansvarsområder. Den arbejder også meget tæt sammen med Det Europæiske Råd gennem formandskaberne, Europa-Parlamentet, Det Europæiske Regionsudvalg og relevante EU-agenturer som f.eks:

• Det Europæiske Center for Forebyggelse af og Kontrol med Sygdomme (ECDC)
• Det Europæiske Lægemiddelagentur (EMA)
• Den Europæiske Fødevaresikkerhedsautoritet (EFSA)
• Det Europæiske Miljøagentur (EEA)
• Det Europæiske Overvågningscenter for Narkotika og Narkotikamisbrug (EMCDDA)
• Det Europæiske Arbejdsmiljøagentur (EU-OSHA)
• Eurostat
• Den Europæiske Investeringsbank (EIB).