LogP-værdien for en forbindelse, som er logaritmen af dens fordelingskoefficient mellem n-octanol og vand log(coctanol/cwater),er et veletableret mål for forbindelsens hydrofilicitet. Lav hydrofilicitet og dermed høje logP-værdier medfører dårlig absorption eller permeation. Det er blevet vist, at for at forbindelser kan have en rimelig sandsynlighed for at blive godt absorberet, må deres logP-værdi ikke være større end 5,0. Fordelingen af beregnede logP-værdier for mere end 3 000 lægemidler på markedet understreger dette forhold (se diagrammet)

Vores interne logP-beregningsmetode er implementeret som et inkrementssystem, der tilføjer bidrag fra hvert atom baseret på dets atomtype. Alt i alt skelner cLogP-prædiktionsmotoren mellem 368 atomtyper, som er sammensat af forskellige egenskaber ved selve atomet (atomnummer og ringtilhørsforhold) og dets direkte naboer (bindingstype, aromaticitetstilstand og kodet atomnummer). Mere end 5 000 forbindelser med eksperimentelt bestemte logP-værdier blev anvendt som træningssæt til at optimere de 369 bidragsværdier, der er knyttet til atomtyperne. Korrelationsplottet (se diagrammet) viser beregnede kontra eksperimentelt bestemte logP-værdier for et uafhængigt testsæt af mere end 5.000 forbindelser, som adskiller sig fra træningssættet.