Nejnovější R a míra růstu

Hodnota R mezi 0,7 a 1,0 znamená, že v průměru každých 10 nakažených nakazí 7 až 10 dalších lidí.

Míra růstu mezi -5 % a -2 % znamená, že počet nově nakažených se každý den zmenšuje o 2 až 5 %.

Odhady R a míry růstu ve Spojeném království jsou průměry za různé epidemiologické situace a měly by být považovány spíše za vodítko pro obecný trend než za popis stavu epidemie. Vzhledem ke stále více lokalizovanému přístupu k řízení epidemie, zejména mezi jednotlivými státy, jsou odhady na úrovni Spojeného království méně vypovídající než dříve.

Tyto odhady představují přenos COVID-19 za posledních několik týdnů vzhledem k časové prodlevě mezi tím, kdy se někdo nakazí, má příznaky a potřebuje zdravotní péči.

Nejnovější odhady podle regionů NHS England

Jedná se o nejnovější odhady R a míry růstu podle regionů NHS England.

Pokud jsou počty případů nebo úmrtí na nízké úrovni a/nebo existuje vysoká míra variability přenosu v rámci regionu, je třeba při interpretaci odhadů R a míry růstu postupovat opatrně. Například značná variabilita napříč regionem v důsledku lokální epidemie může znamenat, že jediná průměrná hodnota neodráží přesně způsob, jakým se infekce v celém regionu mění.

Podle odborného názoru SAGE jsou však odhady z tohoto týdne spolehlivé.

Odhady R a míry růstu jsou uvedeny jako rozmezí a skutečné hodnoty pravděpodobně leží v tomto rozmezí.

Podívejte se na časovou řadu zveřejněných odhadů R a míry růstu (ODS, 20KB) od 29. května 2020 pro:

• UK
• Anglii
• 7 regionů NHS England

Dokument časové řady je pravidelně aktualizován.

Nejnovější pro decentralizované správy

Nejnovější rozsahy hodnot R v decentralizovaných správách jsou zveřejněny na jejich příslušných webových stránkách:

• Odhad R Severního Irska
• Odhad R Skotska
• Odhad R Walesu (Cymraeg)

Další klíčové statistiky

Výzkum ONS o infekcích poskytuje informace o:

• počet nových infekcí dané nemoci zjištěných během určitého časového období (incidence)
• podíl populace, která je v daném časovém okamžiku pozitivní na danou nemoc v komunitě (míra pozitivity nebo prevalence)

Další údaje o testování, případech, zdravotní péči a úmrtích jsou k dispozici na panelu Coronavirus (COVID-19) in the UK dashboard.

O R a rychlosti růstu

R

Rozmnožovací číslo (R) je průměrný počet sekundárních infekcí vyvolaných jednou nakaženou osobou.

Hodnota R 1 znamená, že v průměru každá nakažená osoba nakazí 1 další osobu, což znamená, že celkový počet infekcí je stabilní. Pokud je hodnota R 2, každá nakažená osoba v průměru nakazí další 2 osoby. Pokud je R 0,5, pak v průměru na každé 2 nakažené osoby připadne pouze 1 nová infekce. Pokud je R větší než 1, epidemie roste, pokud je R menší než 1, epidemie se zmenšuje. Čím je R vyšší než 1, tím více lidí 1 nakažený nakazí, a tím rychleji tedy epidemie roste.

R se může v čase měnit. Například klesá, když se snižuje počet kontaktů mezi lidmi, což snižuje přenos. R se zvyšuje, když počet kontaktů mezi lidmi stoupá, což vede k nárůstu přenosu viru.

Rychlost růstu

Rychlost růstu odráží, jak rychle se počet nakažených mění ze dne na den. Jedná se o přibližnou procentuální změnu počtu infekcí každý den. Pokud je míra růstu větší než 0 (+ kladná), pak epidemie roste. Pokud je míra růstu menší než 0 (- záporná), pak se epidemie zmenšuje.

Velikost míry růstu udává rychlost změny. Míra růstu +5 % znamená, že epidemie roste rychleji než míra růstu +1 %. Stejně tak míra růstu -4 % znamená, že epidemie se zmenšuje rychleji než míra růstu -1 %. Další technické informace o tempu růstu naleznete na stránkách časopisu Plus.

Jak se liší tempo růstu od odhadů R

Samotné R nám neříká, jak rychle se epidemie mění. Různé nemoci se stejným R mohou generovat epidemie, které rostou velmi rozdílnou rychlostí. Například 2 nemoci, obě s R=2, mohou mít velmi rozdílnou dobu, za kterou 1 nakažený jedinec nakazí 2 další lidi; jedné nemoci to může trvat roky, zatímco druhé dny.

Růstová rychlost nám poskytuje informaci o velikosti a rychlosti změny, zatímco hodnota R nám poskytuje pouze informaci o směru změny.

Pro výpočet R je zapotřebí informace o době, která uplyne mezi jednotlivými generacemi infekcí. To znamená, jak dlouho trvá, než jedna skupina lidí v nakažené skupině nakazí novou skupinu lidí v další skupině. To může záviset na několika různých biologických, sociálních a behaviorálních faktorech. Míra růstu nezávisí na „generační době“, a proto vyžaduje k odhadu méně předpokladů.

Žádný z ukazatelů, ani R, ani míra růstu, není lepší než druhý, ale každý z nich poskytuje informace, které jsou užitečné při sledování šíření nemoci.

Odhady míry růstu a R se pravidelně aktualizují. Nejsou však jedinými důležitými měřítky epidemie. Obě by měly být zvažovány spolu s dalšími mírami šíření nemoci, jako je počet nových případů nemoci zjištěných během určitého časového období (incidence) a podíl populace s nemocí v daném časovém okamžiku (prevalence). Pokud se R rovná 1 při 100 000 aktuálně nakažených osob, jedná se o zcela odlišnou situaci, než když se R rovná 1 při 1 000 aktuálně nakažených osob. Počet lidí, kteří jsou v současné době nakaženi koronavirem (COVID-19) – a jsou tak schopni virus předat dál – je proto velmi důležitý.

Jak se odhaduje R a míra růstu

K odhadu míry růstu a hodnot R používají jednotlivé modelovací skupiny řadu údajů, mj:

• epidemiologických údajů, jako jsou údaje o testování, hospitalizacích, hospitalizace na jednotkách intenzivní péče a úmrtí – obecně trvá až 3 týdny, než se změny v šíření nemoci projeví v odhadech kvůli časové prodlevě mezi počáteční infekcí a potřebou nemocniční péče
• průzkumy vzorců kontaktů, které shromažďují informace o chování – ty mohou být rychlejší (se zpožděním přibližně jednoho týdne), ale mohou být náchylné ke zkreslení, protože se často spoléhají na vlastní chováníhlášeném chování a vytvářejí předpoklady o tom, jak se shromážděné informace vztahují k šíření nemoci
• průzkumy infekcí v domácnostech, při nichž se provádějí stěry jednotlivců – ty mohou poskytnout odhady, kolik lidí je infikováno. Longitudinální průzkumy (při nichž se opakovaně odebírají vzorky od stejných osob) umožňují přímější odhad růstu počtu nakažených

Různé modelovací skupiny používají k odhadu těchto hodnot různé zdroje dat pomocí matematických modelů, které simulují šíření infekcí. Některé mohou dokonce využívat všechny tyto zdroje informací k úpravě svých modelů tak, aby lépe odrážely reálnou situaci. Ve všech těchto zdrojích dat existuje nejistota, takže odhady se mohou mezi jednotlivými modely lišit, proto se nespoléháme pouze na jeden model. Důkazy z několika modelů jsou zváženy, prodiskutovány, zkombinovány a míra růstu a R jsou pak prezentovány jako rozmezí. Nejpravděpodobnější skutečné hodnoty se nacházejí někde uvnitř těchto rozmezí.

Rozdíly mezi odhady R a odhadovanými mírami růstu jsou způsobeny zaokrouhlováním a rozdíly mezi datovými toky použitými v těchto jednotlivých modelových výstupech, které jsou kombinovány.

Kdo odhaduje R a míry růstu

Míry růstu a R odhaduje několik nezávislých modelovacích skupin sídlících na univerzitách a v Anglii pro veřejné zdraví (PHE). Modelovací skupiny diskutují o svých jednotlivých odhadech R v rámci Science Pandemic Influenza Modelling group (SPI-M) – podskupiny SAGE.

Časové zpoždění odhadů

SPI-M používá několik modelů, z nichž každý při odhadech R a míry růstu využívá údaje z různých zdrojů. Epidemiologická data, jako jsou údaje o hospitalizacích, hospitalizacích na jednotkách intenzivní péče a úmrtích, obvykle potřebují až 3 týdny, aby odrážely změny v šíření onemocnění.

To je způsobeno časovou prodlevou mezi počáteční infekcí, výskytem příznaků a potřebou nemocniční péče. V důsledku toho poslední zveřejněné údaje představují spíše situaci za posledních několik týdnů než dnes. Tyto odhady zatím plně neodrážejí žádné zcela nedávné změny v přenosu způsobené například nedávnými změnami politiky ve Spojeném království.

Omezení R

R je průměrná hodnota, která se může v různých částech země, komunitách a podskupinách populace lišit. Nelze ji měřit přímo, takže kolem její přesné hodnoty vždy panuje nejistota. To se stává ještě větším problémem při výpočtu R pomocí malého počtu případů, ať už z důvodu nižší míry infekce nebo menších geografických oblastí. Tato nejistota může být způsobena variabilitou podkladových dat, což vede k širšímu rozmezí R a častějším změnám odhadů.

I když je celkový odhad R ve Spojeném království nižší než 1, mohou mít některé regiony odhady R, které zahrnují rozmezí přesahující 1, například od 0,7 do 1,1; to nemusí nutně znamenat, že epidemie v daném regionu narůstá, pouze to, že to kvůli nejistotě nelze vyloučit. Je také možné, že epidemie v jednom konkrétním místě může mít za následek R vyšší než 1 pro celý region.

Omezení míry růstu

Míra růstu je průměrná hodnota, která se může měnit. Pokud je počet případů nízký, nejistota se zvyšuje. K tomu může dojít, pokud je nakažena jen velmi malá část osob nebo pokud má uvažovaná zeměpisná oblast velmi malý počet obyvatel. Menší počet případů znamená, že variabilita podkladových údajů ztěžuje odhad tempa růstu; bude udáváno širší rozmezí tempa růstu a časté změny v odhadech. K tomu dojde jak u R, tak u míry růstu. Odhad míry růstu však vyžaduje méně předpokladů o nemoci než R.

I když je celkový odhad míry růstu ve Spojeném království záporný (pod 0), mohou mít některé regiony odhady míry růstu, které zahrnují rozmezí, které je kladné (nad 0), například od -4 % do +1 %. To nutně neznamená, že epidemie v daném regionu roste, pouze to, že to vzhledem k nejistotě nelze vyloučit. Je také možné, že epidemie v jednom konkrétním místě může mít za následek pozitivní (nad 0) míru růstu pro celý region.

Odhady míry růstu pro území menší než regionální úroveň jsou méně spolehlivé a je vhodnější identifikovat lokální ohniska například prostřednictvím sledování počtu případů, hospitalizací a úmrtí.

.