Loggains působil v letech 2012-2013 jako ofenzivní koordinátor v týmu Tennessee Titans, kde byl součástí trenérského štábu Mikea Munchaka. Několik dní poté, co Ken Whisenhunt převzal v roce 2014 funkci hlavního trenéra Titans, byl Loggains informován, že v organizaci nezůstane. Předtím v týmu působil jako trenér zadáků.

Loggains strávil rok 2014 jako trenér quarterbacků v Clevelandu Browns. Byl zastáncem draftování texaského A&M quarterbacka Johnnyho Manziela.

Další rok si Loggains hledal práci. Absolvoval pohovor na místo ofenzivního koordinátora u New York Giants, ale místo toho ho 23. ledna 2015 najali Bears jako trenéra quarterbacků. Pod Loggainsovým vedením prožil quarterback Jay Cutler jednu ze svých nejlepších sezon, když rok 2015 zakončil s 3629 přihrávkovými yardy, 21 touchdowny, 11 interceptiony a kariérními maximy v passer ratingu (92,3) a completion percentage (64,4). Počet 11 interceptions byl nejnižší v jeho kariéře a vedl k procentuálnímu podílu interceptionů 2,3, což je nejnižší hodnota v sezóně, kdy nastoupil alespoň do 12 zápasů, zatímco 21 touchdownů bylo jeho druhým nejvyšším počtem od roku 2011 a 3 629 yardů bylo třetím nejvyšším počtem v jeho kariéře. Na třetím downu měl Cutler 103,2 passer ratingu (čtvrtý v NFL) poté, co dokončil 91 ze 141 přihrávek na 1 242 yardů, sedm touchdownů a dvě interceptions. Naproti tomu proti Seattlu Seahawks záložní quarterback Jimmy Clausen dokončil 9 ze 17 přihrávek za 63 yardů a včetně sacků zaznamenal 48 čistých přihrávkových yardů, což bylo podruhé od sezony 1990, kdy Bears měli méně než 50 čistých přihrávkových yardů. Bears zakončili ročník s 228,9 přihrávajícími yardy na zápas, což je 23. místo v lize, přičemž skupina quarterbacků měla dohromady 63,9 procenta dokončených přihrávek a 2,3 procenta zachycených přihrávek, což je v obou případech třetí místo v historii týmu, spolu s 3 843 hrubými přihrávajícími yardy a 42. místem.5 third down percentage (čtvrté místo), 3 660 čistých přihrávkových yardů (páté místo) spolu s 5 514 celkovými čistými yardy a 89,7 passer rating (šesté místo).

Loggains byl povýšen na pozici ofenzivního koordinátora 11. ledna 2016, když Adam Gase opustil pozici hlavního trenéra Miami Dolphins. Během Loggainsova působení ve funkci OC se Bears potýkali s problémy, v listopadu 2017 se v žebříčku ESPN umístil na posledním místě mezi 32 playcallery, zatímco útok zakončil sezónu 2017 s průměrem pouhých 16,5 bodu na zápas (29. místo v lize). Po propuštění hlavního trenéra Johna Foxe se Loggains znovu spojil s Gasem v Miami a získal další pozici ofenzivního koordinátora.

Dne 23. ledna 2019 se Loggains znovu spojil s Adamem Gasem poté, co byl najat jako ofenzivní koordinátor/trenér quarterbacků v týmu New York Jets. 25. října 2020 se v očekávání utkání 7. týdne proti Buffalu Bills hlavní trenér Adam Gase vzdal funkce offensive play callera a předal ji Loggainsovi. Navzdory dobrému výkonu v prvním poločase, kdy vedl 10:6, se Loggainsovi ve druhém poločase nepodařilo získat dynamiku, což vyvrcholilo prohrou 18:10 s Buffalem. Dne 28. října 2020, před utkáním s Kansas City Chiefs, bylo oznámeno, že Loggains bude opět pověřen vedením ofenzivních rozehrávek

.