cLogP Calculation

Hodnota logP sloučeniny, která je logaritmem jejího rozdělovacího koeficientu mezi n-oktanolem a vodou log(koktanol/voda), je dobře zavedenou mírou hydrofilnosti sloučeniny. Nízká hydrofilita, a tedy vysoké hodnoty logP způsobují špatnou absorpci nebo permeaci. Bylo prokázáno, že aby měly sloučeniny přiměřenou pravděpodobnost dobré absorpce, nesmí být jejich hodnota logP vyšší než 5,0. Tuto skutečnost podtrhuje rozložení vypočtených hodnot logP více než 3 000 léčiv na trhu (viz graf)

Naše vlastní metoda výpočtu logP je implementována jako přírůstkový systémpřičítající příspěvky každého atomu na základě jeho typu. Dohromady predikční engine cLogP rozlišuje 368 typů atomů, které se skládají z různých vlastností samotného atomu (atomové číslo a příslušnost ke kruhu) i jeho přímých sousedů (typ vazby, stav aromaticity a kódované atomové číslo). Více než 5000 sloučenin s experimentálně stanovenými hodnotami logPbylo použito jako tréninková sada pro optimalizaci 369 hodnot příspěvků spojených s typy atomů. Korelační graf (viz graf) ukazuje vypočtenéproti experimentálně stanoveným hodnotám logP nezávislé testovací sady více než 5000 sloučenin, které se liší od trénovací sady.

.